Synen framför honom liknar inget han sett förut. Hästen som verkar kippa efter luft, trots att dess hjärta slutat att slå. Huvudet som flyter i tjärnen, ögonen som tycks vädja till honom eller vilja berätta något. Nästan som en människa, fast ändå inte.
Inom loppet av ett dygn hittas en dränkt hingst och en mördad tonårspojke i de djupa skogarna utanför Nässjö. Polischefen Alexander Stenborg, som nyss tvingades lämna Stockholmspolisen under förnedrande omständigheter, gör först ingen koppling mellan de två händelserna.
Alexander har just flyttat med sin fru Sofia till den idylliska byn Ormaryd, och de hoppas på en nystart i förhållandet. Sofia som är gravid har bestämt sig för att knyta an till mamma och morfar efter karriäråren i Stockholm. Trots att mamma är motsträvig och morfar dement är Sofia fast besluten att ta reda på vem som är hennes pappa.
Men människorna i byn beter sig märkligt mot henne, inte minst den pastor som håller i ett tältmöte. Det är något som inte står rätt till i den lilla byn.
Mörkret faller över skogen är en suggestiv spänningsroman om ett litet samhälle där tron på väsen är lika stark som tron på Gud själv. Ingenting är som det först verkar och ondskan visar sig långt råare och mer skoningslös än det unga paret kunnat föreställa sig.