Eletään 1960-luvun alkupuolta. Yhdysvaltojen ja Neuvostoliiton välinen kilpajuoksu avaruuteen on kiihkeimmillään. Etsiessään päteviä työntekijöitä Yhdysvaltain avaruushallintovirasto NASA löytää odottamattomia kykyjä naispuolisten värillisten matematiikanopettajien parista.
Vastoin kaikkea todennäköisyyttä naisista tulee osa NASAn ihmislaskijoita. Heidän laskelmansa auttavat toteuttamaan erään Yhdysvaltojen historian suurimmista saavutuksista – lähettää astronautti kuuhun.
Hidden Figures – Varjoon jääneet kertoo ensimmäistä kertaa Dorothy Vaughanin, Mary Jacksonin, Katherine Johnsonin ja Christina Dardenin tarinan.